Sistem dokumentasi mengindikasikan adanya keselarasan tahap perencanaan, implementasi, dan pengendalian proses bisnis di PDIA FIA UB. Dokumen digunakan sebagai 1) alat komunikasi yang efektif, 2) sebagai pengontrol konsistensi kegiatan untuk menghasilkan lulusan PDIA yang sesuai dengan Capaian Pembelajaran yang telah ditetapkan, serta 3) sebagai bagian penting untuk meningkatkan mutu berkelanjutan.
Sistem dokumen di PDIA FIA UB meliputi beberapa Manual Prosedur dan Instruksi Kerja sesuai dengan proses bisnis dan layanan akademik di PDIA FIA UB