Program studi Perpajakan ini akan dipimpin oleh seorang Ketua Program yang bertanggung jawab langsung kepada Ketua Jurusan Administrasi Bisnis Fakultas Ilmu Administrasi Universitas Brawijaya dengan dibantu oleh seorang Sekretaris Program Studi yang akan bertanggungjawab kepada Ketua Program Studi. Dalam operasional pendidikan, Ketua Program Studi juga dibantu tenaga administrasi dan kepala laboratorium yang bernaung dibawah Program Studi Perpajakan.
